Das AlpES Projekt besteht aus verschiedenen Arbeitspaketen. Neben den Arbeitspaketen von Management und Kommunikation, gibt es vier Arbeitspakete, die jeweils von einem anderen Projektpartner geleitet und von allen Projektpartnern unterstützt werden.

1. Arbeitspaket Ökosystemleistungen - Alpines Konzept, Institut für Umweltplanung und Raumentwicklung
2. Arbeitspaket Kartierung und Bewertung, Europäische Akademie von of Bozen/Bolzano
3. Arbeitspaket WebGIS & WIKIAlps, Institut für Interdisziplinäre Gebirgsforschung/Österreichische Akademie der Wissenschaften
4. Arbeitspaket Kapazitätsbildungs-Modell, Stiftung für Bergsicherheit
5. Arbeitspaket Management, Europäische Akademie von of Bozen/Bolzano
6. Arbeitspaket Kommunikation, Umweltbüro (Fürstentum von Liechtenstein)/CIPRA International